Родился в Ялте в семье почтово-телеграфного механика. В 1911 году его семья переехала в Москву. В 1926 году Борис окончил школу и поступил на работу товарным кассиром железной дороги.
С 1934 года его снимки публиковались в газетах «Правде», «Известиях», «Комсомольской правде», «Вечерней Москве», «Sovietland», «Moscow News», журналах «Огоньке», «Индустрия», «Крестьянка», «Работница», «Journal de Moscou», «Физкультура и спорт» и многих других периодических изданиях. Темы фотоснимков: промышленность, спорт, авиаторы, повседневная жизнь, молодёжь, армия.
В ноябре 1941 года Борис Евгеньевич ушёл добровольцем на Великую Отечественную войну. Был фотокорреспондентом фронтовой газеты «Вперёд на врага» Калининского, а затем 1-го Прибалтийского фронта. В декабре 1941 года снимал наступление Красной армии на Калинин, Ржев и Старицу. Во время войны совершил 29 боевых вылетов в качестве воздушного стрелка, фотографировал боевые действия: авиации, артиллерии, танковых соединений, инженерных войск и пехоты, фронтовой быт, строительство оборонительных сооружений, работу связи и госпиталей, отдых бойцов, а разрушенные города и работ по их восстановлению.
По окончании войны работы Вдовенко печатались в журналах «Огонёк», «Советский Союз», «Крылья Родины», газетах «Советская Россия», «Советская торговля».
Работы Бориса Евгеньевича Вдовенко представлены из фонда Музея Российской Фотографии (г. Коломна).
